Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Col5a3Q9JLI2 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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