Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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