Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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Sgo1Q9CXH7 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sgo1Q9CXH7 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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