Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RpainQ9CWY9 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms