Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gtpbp3Q923K4 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms