Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Uhrf1Q8VDF2 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Uhrf1Q8VDF2 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.9 ms