Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NischQ80TM9 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NischQ80TM9 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.2 ms