Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms