Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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