Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms