Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ebf1Q07802 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ebf1Q07802 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ebf1Q07802 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ebf1Q07802 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ebf1Q07802 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ebf1Q07802 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ebf1Q07802 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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