Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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VdrP48281 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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VdrP48281 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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VdrP48281 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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VdrP48281 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
VdrP48281 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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