Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp4P35123 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms