Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RxraP28700 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RxraP28700 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms