Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd9P28357 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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