Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Ggta1P23336 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Ggta1P23336 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms