Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpraP18052 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpraP18052 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms