Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Hdac6Q9Z2V5 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Hdac6Q9Z2V5 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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