Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf4Q9QZS2 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms