Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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