Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms