Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms