Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms