Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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