Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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VdrP48281 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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VdrP48281 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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VdrP48281 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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VdrP48281 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
VdrP48281 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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VdrP48281 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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