Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp4P35123 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms