Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd8P23463 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms