Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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