Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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Gm20795J3QP49 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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Gm20795J3QP49 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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Gm20795J3QP49 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Gm20795J3QP49 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Gm20795J3QP49 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Gm20795J3QP49 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Gm20795J3QP49 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Gm20795J3QP49 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Gm20795J3QP49 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Gm20795J3QP49 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Gm20795J3QP49 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Gm20795J3QP49 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Gm20795J3QP49 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms