Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Herc1E9PZP8 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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