Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.7 ms