Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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H2-M5A7VMS3 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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H2-M5A7VMS3 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M5A7VMS3 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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