Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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