Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf6Q9DBU5 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf6Q9DBU5 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf6Q9DBU5 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf6Q9DBU5 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf6Q9DBU5 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf6Q9DBU5 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rnf6Q9DBU5 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rnf6Q9DBU5 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Rnf6Q9DBU5 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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