Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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