Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Cnot11Q9CWN7 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnot11Q9CWN7 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms