Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl39lQ9CQD0 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms