Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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NipblQ6KCD5 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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