Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc18Q640L5 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc18Q640L5 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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