Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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