Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms