Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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