Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Lire1P11260 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Lire1P11260 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms