Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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Ccl20O89093 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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Ccl20O89093 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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Ccl20O89093 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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Ccl20O89093 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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Ccl20O89093 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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Ccl20O89093 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
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Ccl20O89093 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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Ccl20O89093 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccl20O89093 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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