Protein–RNA interactions for Protein: B1ART2

Vps13d, Vacuolar protein sorting 13D, mousemouse

Predictions only

Length 4,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13dB1ART2 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Vps13dB1ART2 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms