Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms