Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SgshQ9EQ08 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms