Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf6Q9DBU5 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms