Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
PtprtQ99M80 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms