Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.5 ms